这种分子可以被认为是非活性染料，用于控制样品和仪器校准。为了与胺和蛋白质标记偶联，考虑使用Cy5-NHS酯，或水溶性硫酸-Cy5-NHS酯。Cyanine5 carboxylic acid羧酸Cy5 COOH

BOC保护了用于标记醛和酮的氰基5酰肼活性染料。 BOC -（叔丁氧羰基）保护基可以用强酸去除。反应酰肼形成，然后可以与各种羰基偶联产生氰基5标记的分子。Cyanine5 Boc-hydrazide标记活性染料

氰基5叠氮标记试剂点击化学，可用作DMSO中的10毫米溶液，并以固体形式存在。 该叠氮化物可溶于有机溶剂（例如DMSO、DMF），因此标记反应应该用少量的有机共溶剂进行。该叠氮化物可用于将炔烃修饰的生物分子标记在水与有机溶剂的混合物中。DMSO中的溶液已准备好用于生物缀合。该试剂的水溶性磺化版本也可用。Cyanine5 azide Cy5 N3活体荧光成像

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